Glam, я вас все равно не понимаю.
Если речь идет о начисление по больничному листу, то, как заметила Светлана Владимировна, средний заработок по больным в течение года не меняется (за исключением случая, когда сотрудник принес справки с предыдущих мест работы).
Следовательно, 3 дня по больничному листу должны для обоих ваших случаев равны.
Цитата: 1.Пособия по временной нетрудоспособности, по беременности и родам, ежемесячное пособие по уходу за ребенкомисчисляются исходя из среднего заработка застрахованного лица, рассчитанного за два календарных года, предшествующих году наступления временной нетрудоспособности, отпуска по беременности и родам, отпуска по уходу за ребенком, в том числе за время работы (службы, иной деятельности) у другого страхователя (других страхователей). Средний заработок за время работы (службы, иной деятельности) у другого страхователя (других страхователей) не учитывается в случаях, если в соответствии с частью 2 статьи 13 настоящего Федерального закона пособия по временной нетрудоспособности, по беременности и родам назначаются и выплачиваются застрахованному лицу по всем местам работы (службы, иной деятельности) исходя из среднего заработка за время работы (службы, иной деятельности) у страхователя, назначающего и выплачивающего пособия. В случае, если в двух календарных годах, непосредственно предшествующих году наступления указанных страховых случаев, либо в одном из указанных годов застрахованное лицо находилось в отпуске по беременности и родам и (или) в отпуске по уходу за ребенком, соответствующие календарные годы (календарный год) по заявлению застрахованного лица могут быть заменены в целях расчета среднего заработка предшествующими календарными годами (календарным годом) при условии, что это приведет к увеличению размера пособия.
Цитата: Про 3 дня это было, что сотрудник отработал 3 дня всего в феврале месяце, а остальное время провел на больничном.
Вы смешали все в одну кучу: зарплата учитывается отдельно, начисления по больничным отдельно (для целей НДФЛ, страховых взносов и бухгалтерского учета).
Далее, если у вас не льготный тариф по страховым взносам и начисление взносы на случай временной нетрудоспособности у вас не равны нулю, то
Цитата: 2. Сумма страховых взносов на обязательное социальное страхование на случай временной нетрудоспособности и в связи с материнством уменьшается плательщиками страховых взносов на сумму произведенных ими расходов на выплату страхового обеспечения по указанному виду обязательного социального страхования в соответствии с законодательством Российской Федерации.
т.е. не обязательно подавать на возмещение: может у вас еще нужно будет доплачивать страховые взносы.
Естественно, все это рассмотрено для случая, если у вас в регионе не действует пилотный проект.